Sarah Schneider vom Center for Vision, Automation & Control, Forschungsgruppe High-Performance Vision Systems, hat nicht nur ihre Masterthesis mit dem Titel „Segmentation of collagen fibrils and proteoglycans from reconstructed tilt series acquired by TEM.“, erfolgreich abgeschlossen, sondern ihr Ergebnisse wurden im Journal „Acta Biomaterialia“ im Rahmen eines Papers veröffentlicht. Das Paper „ An ultrastructural 3D reconstruction method for observing the arrangement of collagen fibrils and proteoglycans in the human aortic wall under mechanical load” befasst sich mit der Forschung an biomechanischen Eigenschaften von menschlichen Aorten.
Besonderes Augenmerk wurde dabei auf zwei Bestandteile des Gewebes gelegt – Kollagen Fibrillen und Proteoglykane. Aorten-Proben wurden verschieden starken mechanischen Belastungen ausgesetzt und das Gewebe dann von einem Transmissions-Elektronenmikroskop aufgenommen. In den drei-dimensionalen Bilddaten wurden dann die Kollagen-Fibrillen und die Proteoglykane segmentiert und untersucht, wie diese zueinander angeordnet sind und wie sich deren Anordnung zueinander verändert, wenn das Gewebe mechanisch stimuliert wird.
„In der Abbildung sieht man die Segmentierung sehr schön, die langen grünen Stränge sind die Kollagen-Fibrillen und die gelben kleineren Objekte die Proteoglykane.“, so Sarah Schneider.
Das Paper hat nicht nur die Forschungen aus Sarah‘s Masterarbeit einbezogen, zusätzlich hat das Team den Best Collaborative Paper Award 2022 gewonnen!
Mittlerweile arbeitet Sarah Schneider bei High- Performance Vision Systems schon am nächsten Projekt, nämlich ihrer Dissertation mit dem Thema „Explainable AI for Anomaly Detection“.
Herzlichen Glückwunsch zu diesem Erfolg!
Hier gehts zum Paper:
Anna Pukaluk, Anna-Sophie Wittgenstein, Gerd Leitinger, Dagmar Kolb, Dominique Pernitsch, Sarah A. Schneider, Patrick Knöbelreiter, Verena Horak, Kristian Bredies, Gerhard A. Holzapfel, Thomas Pock, Gerhard Sommer: An ultrastructural 3D reconstruction method for observing the arrangement of collagen fibrils and proteoglycans in the human aortic wall under mechanical load;
Acta Biomaterialia, Volume 141, 2022, Pages 300-314,
ISSN 1742-7061
https://doi.org/10.1016/j.actbio.2022.01.036.