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Bioinformatik

Die heutige personalisierte Medizin stützt sich auf eine gründliche Kenntnis des genetischen und epigenetischen Repertoires von Krankheiten und die Verfügbarkeit neuartiger Wirkstoffe, die auf veränderte Gene und Signalwege abzielen. Daher werden automatisierte und zuverlässige Methoden zur Analyse und Interpretation dieser Daten benötigt, um eine maximale Aussagekraft sowie Kosten- und Zeiteffizienz in der medizinischen Diagnostik zu erreichen.

Unsere Bioinformatik-Dienstleistungen reichen von der Versuchsplanung über die Auswahl von Merkmalen und die Standardisierung von Tests bis hin zur Entwicklung von Entscheidungshilfesystemen. Ein Schwerpunkt unserer Forschung liegt auf der Analyse von Sequenzierungsdaten. Wir verfügen über umfassende Erfahrung in der Analyse von Daten, die mit verschiedenen Hochdurchsatztechnologien (einschließlich Sequenzierung) gewonnen wurden, und können daher optimale Unterstützung in diesem Bereich bieten.

SERVICES

Versuchsplanung: Probenauswahl, Wahl der Plattform, bewährte Verfahren
Assay-Design und -Analyse für die Validierung von Biomarkern: Screening mit Microarrays und Sequenzanalyse, kundenspezifische Datenanalyse
Maßgeschneiderte Module für die Identifizierung und Validierung von Biomarkern: multivariate Statistik, Identifizierung und Anwendung der geeigneten statistischen Modelle
Datenanalyse von NGS-Experimenten: Ganzgenomsequenzierung, Ganz-Exomsequenzierung, RNA-Sequenzierung, Bisulfit-Sequenzierung
Entwicklung von Entscheidungshilfesystemen auf der Grundlage von Biomarkern und klinischen Studien
Mikrobiom-Studien: Analyse-Setup, Datenanalyse und Interpretation der Ergebnisse
Genomassemblierung: Generierung von Contigs und Scaffolds, Annotation, Genidentifizierung und -analyse, Homologieanalyse
Pipeline-Entwicklung: NGS-Datenanalyse, qPCR-Datenanalyse, Erstellung von grafischen Eingabemasken für Benutzer ohne bioinformatischen Hintergrund
In-silico-Assay-Design & Analyse-Lösungen für die Validierung von Standard-Biomarkern
Benutzerfreundliche Datenanalysesoftware für Point-of-Care (mobile) Geräte

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DI Klemens Vierlinger

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