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Bioinformatik

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Bioinformatik

Die heutige personalisierte Medizin stützt sich auf eine gründliche Kenntnis des genetischen und epigenetischen Repertoires von Krankheiten und die Verfügbarkeit neuartiger Wirkstoffe, die auf veränderte Gene und Signalwege abzielen. Daher werden automatisierte und zuverlässige Methoden zur Analyse und Interpretation dieser Daten benötigt, um eine maximale Aussagekraft sowie Kosten- und Zeiteffizienz in der medizinischen Diagnostik zu erreichen.

Unsere Bioinformatik-Dienstleistungen reichen von der Versuchsplanung über die Auswahl von Merkmalen und die Standardisierung von Tests bis hin zur Entwicklung von Entscheidungshilfesystemen. Ein Schwerpunkt unserer Forschung liegt auf der Analyse von Sequenzierungsdaten. Wir verfügen über umfassende Erfahrung in der Analyse von Daten, die mit verschiedenen Hochdurchsatztechnologien (einschließlich Sequenzierung) gewonnen wurden, und können daher optimale Unterstützung in diesem Bereich bieten.

Portraitfoto von Klemens Vierlinger

DI Klemens Vierlinger

Molecular Diagnostics

SERVICES

  • Versuchsplanung: Probenauswahl, Wahl der Plattform, bewährte Verfahren
  • Assay-Design und -Analyse für die Validierung von Biomarkern: Screening mit Microarrays und Sequenzanalyse, kundenspezifische Datenanalyse
  • Maßgeschneiderte Module für die Identifizierung und Validierung von Biomarkern: multivariate Statistik, Identifizierung und Anwendung der geeigneten statistischen Modelle
  • Datenanalyse von NGS-Experimenten: Ganzgenomsequenzierung, Ganz-Exomsequenzierung, RNA-Sequenzierung, Bisulfit-Sequenzierung
  • Entwicklung von Entscheidungshilfesystemen auf der Grundlage von Biomarkern und klinischen Studien
  • Mikrobiom-Studien: Analyse-Setup, Datenanalyse und Interpretation der Ergebnisse
  • Genomassemblierung: Generierung von Contigs und Scaffolds, Annotation, Genidentifizierung und -analyse, Homologieanalyse
  • Pipeline-Entwicklung: NGS-Datenanalyse, qPCR-Datenanalyse, Erstellung von grafischen Eingabemasken für Benutzer ohne bioinformatischen Hintergrund
  • In-silico-Assay-Design & Analyse-Lösungen für die Validierung von Standard-Biomarkern
  • Benutzerfreundliche Datenanalysesoftware für Point-of-Care (mobile) Geräte