In Zusammenarbeit mit der UMIT wurde eine web-basierte Datenmanagementplattform entwickelt, mit deren Hilfe sich ergänzende genomische, proteomische und metabolische Daten von Proben von Patienten mit Prostata-Krebs in ein 'Life Science Integrative Data Warehouse' (LINDA) integriert und analysiert werden.

Das System wird derzeit innerhalb des IMGuS (Institut für Medizinische Genomik und Systembiologie) Pilotprojektes Systems Biology in Prostate Cancer II verwendet, unterstützt die dokumentierte Datenzusammenführung und stellt Werkzeuge für spezifische Datenabfragen und Analysen bereit.

Partner:

  • Univ.-Prof. Dr. Christian Baumgartner, UMIT, Hall i.T.

Referenzen:

Schreier G, Messmer J, Rauchegger G, Modre-Osprian R, Ladenstein R. A Web-based platform for interdisciplinary biomedical research. Front Biosci. 2009 Jan 1;14:2738-46.

Pfeifer B, Tejada MM, Kugler K, Osl M, Netzer M, Seger M, Modre-Osprian R, Schreier G, Tilg B. A biomedical knowledge discovery in databases design tool - Turning data into information In: Schreier G, Hayn D, Ammenwerth E, editors. eHealth2008 - Medical Informatics meets eHealth: Tagungsband der eHealth2008: Medical Informatics meets eHealth. 2008 Mai 29-30; Vösendorf bei Wien, Austria. 2008. p. 151-156

Pfeifer B, Baumgartner C, Plant C, Modre R, Schreier G, Tilg B. Integration biomedizinischer Daten in einer klinischen Bioinformatik Plattform. In: Schreier G, Hayn D, Ammenwerth E, editors. Tagungsband der eHealth2007: Medical Informatics meets eHealth. 2007 Jun 1; Wien, Austria. 2007. p. 25-28

Pfeifer B, Aschaber J, Baumgartner Ch, Dreiseitl S, Modre-Osprian R, Schreier G, Tilg B. A data warehouse for prostate cancer biomarker discovery. In: Proceedings BioComp 2007. Las Vegas, USA, 2007. Vol 2: p. 316-323

Pfeifer B, Aschaber J, Baumgartner Ch, Dreiseitl S, Modre-Osprian R, Schreier G, Tilg B. A Life Science Data Warehouse System to enable Systems Biology in Prostate Cancer. In: Proceedings 4th International Workshop, DILS 2007, Pennsylvania, USA, 2007 p. 9ff