Biomarker sind charakteristische und objektiv messbare biologische Merkmale, die auf einen normalen biologischen oder krankhaften Prozess im Körper hinweisen können.

Bei einem Biomarker kann es sich um Zellen, Gene, Genprodukte oder bestimmte Moleküle wie Enzyme oder Hormone handeln. Auch komplexe Organfunktionen oder charakteristische Veränderungen biologischer Strukturen werden als medizinische Biomarker herangezogen.

Wir entwickeln Biomarker für die frühe Diagnose und gezielte Therapie von Krebs und komplexen Erkrankungen. Bei Krebs kommt es zu weitreichenden genetischen und epigenetischen Veränderungen mit komplexen Auswirkungen auf die Genregulierung, -expression und -translation. Zur Verbesserung von Diagnostik und Therapie sind multivariate Analysen verschiedener Biomoleküle erforderlich, um der Komplexität altersbedingter Krankheiten gerecht zu werden.

Der Schwerpunkt liegt dabei auf nukleinsäure- und proteinbasierten Biomarkern und reicht von genomweiten Screenings, Bioinformatik und Softwareentwicklung zur Analyse komplexer Daten über die Validierung der gefundenen Biomarker bis hin zur Entwicklung maßgeschneiderter  diagnostischer Tests inklusive zugehöriger Softwarelösungen.

Wir bieten dazu die folgenden Leistungen an:

• Biomarker-Screening:
  • Effizientes Auffinden von Biomarkern durch Anwendung von Hochdurchsatz-
          Technologien (DNA/Protein Microarrays, Next Generation Sequencing)
          auf der Basis von RNA, DNA (-Methylierung) oder Autoantikörpern.
    
    

• Validierung von Biomarkern und Entwicklung von diagnostischen Assays:
  
  • Design, Etablierung und Anwendung von Assays, die auf wenige relevante
           Biomarker beschränkt sind.
  • Validierung der Biomarker an großen Patientenkollektiven mit speziellem
           Augenmerk auf dem Einsatz kliniktauglicher und kostengünstiger
           Technologien (z.B. nanoliter real-time PCR, beadbasierte Protein-Assays).
  • Zugang zu großen Patientenkollektiven für retrospektive und prospektive
           Validierungen der Biomarker.
    
    

• Bioinformatik & Software-Lösungen:
  • Anwendungsspezifische Softwarelösungen für automatisierte, lückenlose
           rückverfolgbare Hochdurchsatzanalysen.
  • Erstellung kundenspezifischer Workflows für Assay-Design,
           Datenauswertung und Decision Support.

Referenzprojekte:

• FP7: RESOLVE
• Evaluation of serum-autoantibody biomarkers for early diagnostic testing
       of colon and prostate cancers life science krems
• WWTF: Serum-autoantibody testing for early diagnosis of breast cancer 
• ÖNB: Methyrostar
• ÖNB: Evaluierung von Autoantikörper-Serum-Biomarkern zum Brust-Krebs
       Screening
• FP7: EURHEALTHAGEING  “European ResearcH on DevElopmentAL, BirtH and
       Genetic Determinants of Ageing “